تسعى الادارة العامة للشؤون المالية الى تنفيذ العمليات المالية و المحاسبية لميزانية الجامعة وفقاً لتعليمات الميزانية السنوية و حسب الاعتمادات المالية المخصصة لميزانية الجامعة، و ذلك من خلال تطبيق اللوائح و الانظمة و التعاميم و القرارات و توجيهات معالي رئيس الجامعة، كما تهدف الى تحقيق المستوى اللازم من التنسيق بين الجامعة و جميع الاجهزة الحكومية الاخرى في المسائل المشتركة فيما يتعلق بالشؤون المالية كوزارة المالية و ديوان المراقبة العامة، إضافة الى تطوير اسلوب العمل المالي في الجامعة بما يساهم في تميز و ريادة الادارة المالية في جامعة جدة.